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云南大学生态学与地植物学研究所
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高校
- 曾用名：云南大学生态学与地植物学研究室
- 负责人：欧晓昆 省市：云南昆明 成立时间：1983年
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学科研究范围：植被生态学研究；景观生态学研究；人类生态学研究；种群与生理生态学研究；蕨类植物学研究；城市生态学研究；昆虫生态学研究。
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云南省古生物研究重点实验室
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省部级
- 曾用名：云南大学澄江动物群研究中心
- 负责人：侯先光 省市：云南昆明 成立时间：2004年
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学科研究范围：寒武纪早期生物研究；古植物学研究；古脊椎动物学研究；地球化学研究。
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3
云南大学西南边疆少数民族研究中心
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高校
- 负责人：何明 省市：云南昆明 成立时间：2001年
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学科研究范围：魁阁研究；民族关系与民族问题研究；跨境民族与边疆问题研究；非物质文化遗产研究；影视人类学研究。
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4
云南农业大学
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- 曾用名：云南大学农学院
- 负责人：盛军 省市：云南昆明
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5
云南大学滇池学院
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- 负责人：马杰 省市：云南昆明
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6
自然资源药物化学教育部重点实验室 云南大学省部共建教育部自然资源药物化学教育部重点实验室
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省部级
- 负责人：张洪彬 省市：云南昆明 成立时间：2008年
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学科研究范围：天然产物及其类似化合物的合成及构效关系研究；云南民族民间药用资源的化学成份及生理活性研究；云南药用植物有效化学成份的分离分析方法研究；云南丰产植物化学成份的开发利用及药物中间体合成研究；与药物研发相关的材料化学与催化化学研究；药物资源保护与利用研究；药物设计与构效关系研究。
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7
云南大学软科学与系统工程研究中心
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高校
- 负责人：张正华 省市：云南昆明 成立时间：1988年
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学科研究范围：区域发展系统工程；管理系统工程；R和D管理；管理信息系统(MIS)；决策支持系统(DSS)；山地民族区域经济开发；区域持续发展；非线性经济学。
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8
云南大学旅游文化学院
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- 负责人：李平 省市：云南丽江
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9
云南大学高等教育研究院
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高校
- 负责人：董云川 省市：云南昆明 成立时间：2002年
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10
云南大学滇池学院图书馆
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- 省市：云南昆明 成立时间：2001年
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