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南京大学中国新文学研究中心
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高校
- 曾用名：南京大学中国现代文学研究中心 南京大学中国现代文学教学与研究室 南京大学中文系中国现代文学研究所 中央大学文学研究室
- 负责人：丁帆 省市：江苏南京 成立时间：1999年
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学科研究范围：中国现当代小说研究；中国现当代文学思潮与社团流派研究；启蒙文化与中国现当代文学研究；中国现当代戏剧史研究。
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2
海岸与海岛开发教育部重点实验室
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省部级
- 曾用名：南京大学海岸与海岛开发国家试点实验室 南京大学海洋地貌与沉积实验室 南京大学地理学系海岸研究组和海洋地貌与沉积研究室 南京大学海岸与海岛开发国家专业实验室
- 负责人：鹿化煜 省市：江苏南京 成立时间：2000年
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学科研究范围：海岸海洋地貌沉积演变与环境利用；海洋沉积动力过程；极地海洋环境的过程与机理；海陆环境与气候演变对比；海陆表观测与地理信息系统；过去人类活动与环境。
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南京大学中德法学研究所
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高校
- 曾用名：南京大学－哥廷根大学中德经济法研究所
- 负责人：邵建东 省市：江苏南京 成立时间：1989年
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南京大学城市科学研究院
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高校
- 曾用名：南京大学城市科学研究中心
- 负责人：张鸿雁 省市：江苏南京 成立时间：2010年
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学科研究范围：动物营养需要研究研究；饲料营养价值评定研究；优质畜产品营养调控技术研究；饲料和饲料添加剂有效性试验研究；安全高效饲料配制技术研发；非常规饲料生物改造技术研究。
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5
南京大学公共事务与地方治理研究中心
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高校
- 曾用名：南京大学中国政治与行政发展研究所
- 负责人：张永桃 省市：江苏南京 成立时间：1997年
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学科研究范围：政府管理与政治过程研究；地方治理与公共政策研究；政治心理与政治文化研究；社会稳定与危机管理；社会组织与民众行为研究。
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6
南京大学海洋科学研究院
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高校
- 曾用名：南京大学海洋科学研究中心
- 负责人：高抒 省市：江苏南京 成立时间：2012年
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南京大学区域发展研究所 南京大学非洲研究所
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高校
- 负责人：周生路 张振克 省市：江苏南京 成立时间：1965年
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学科研究范围：非洲资源、非洲农业、非洲城市化与乡村发展、港口与区域发展研究。
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8
南京大学国际关系研究院
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高校
- 曾用名：南京大学国际关系研究所
- 负责人：朱瀛泉 省市：江苏南京 成立时间：2000年
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学科研究范围：欧洲国际关系研究；美国对外关系研究；亚太国际关系研究；中东国际关系研究；当代国际问题研究；国际关系理论研究；国际战略研究；国际政治经济学研究；中外关系研究。
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9
南京大学宜兴环保研究院
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高校
- 曾用名：南京大学-宜兴环保科技研发中心
- 负责人：任洪强 省市：江苏南京 成立时间：2010年
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10
南京大学分离工程研究中心
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省部级
- 曾用名：南京大学应用化学实验室
- 负责人：张志炳 省市：江苏南京 成立时间：1995年
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学科研究范围：塔器分离技术研究；新型能源化学研究；生物制品和药物加工；分子计算和化工过程模拟研究；新型化工分离技术研究；精细化学品研究和开发；催化过程和催化材料研究。
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