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复旦大学激光化学研究所
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高校
- 曾用名：复旦大学激光化学研究室 复旦大学激光化学实验室
- 负责人：周鸣飞 成立时间：1978年
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学科研究范围：低温基质隔离分子的物理化学研究；用脉冲激光沉积法制备金属氧化物功能性薄膜及其物理化学过程研究。
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2
复旦大学中国古代文学研究中心
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高校
- 曾用名：复旦大学古籍整理研究所
- 负责人：黄霖 成立时间：1999年
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学科研究范围：中国古代文学研究；中国文学批评史研究；中国古典文献学研究；中国文学古今演变研究；汉语言文字学研究。
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3
复旦大学血管外科研究所
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高校
- 曾用名：上海医科大学中山医院血管外科研究室 复旦大学附属中山医院血管外科研究室 上海医科大学血管外科研究室
- 负责人：王玉琦 成立时间：1999年
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学科研究范围：血管移植物内膜增生机理和防治研究；腔内血管外科研究；多发性大动脉炎病因及发病机制研究；下肢动脉硬化闭塞症的实验及临床研究。
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复旦大学社会发展与公共政策学院人口研究所
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高校
- 曾用名：复旦大学经济系人口研究室
- 负责人：王桂新 成立时间：1979年
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学科研究范围：公共政策最优决策；人口老龄化战略和社会保障制度改革；城市化与区域经济可持续发展研究；资源与环境保护的社会机制；社会性别研究。
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5
复旦大学遗传学研究所
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高校
- 曾用名：复旦大学遗传学研究室
- 负责人：赵寿元 成立时间：1961年
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学科研究范围：人类医学遗传学研究；群体和进化遗传学研究；微生物遗传学研究；植物遗传学研究；发育遗传学和遗传工程研究。
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6
复旦大学中西医结合研究所
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高校
- 曾用名：上海复旦大学附属华山医院中西医结合研究所 上海医科大学中西医结合研究所
- 负责人：王文健 成立时间：1985年
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学科研究范围：中西医结合藏象学说研究；中西医结合代谢病研究；中西医结合妇产科学研究；中西医结合肿瘤防治研究；中西医结合儿科学研究。
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7
复旦大学枫林校区 复旦大学上海医学院
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- 曾用名：上海医科大学
- 负责人：桂永浩
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复旦大学眼耳鼻喉科医院眼科研究所
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高校
- 曾用名：上海第一医学院眼科研究所 上海复旦大学眼科研究所 上海医科大学眼科研究所
- 负责人：褚仁远 成立时间：1978年
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学科研究范围：临床眼科应用研究；神经系统的功能发育、眼内压与视功能的关系。
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9
复旦大学中国社会主义市场经济研究中心
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高校
- 曾用名：复旦大学经济研究中心
- 负责人：张军 成立时间：2002年
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10
复旦大学脑科学研究院 复旦大学脑科学研究中心
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高校
- 负责人：马兰 成立时间：2006年
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学科研究范围：神经活动基本过程研究；脑的高级功能研究；神经系统重要疾病机制与防治研究。
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